白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

作者：申婷婷; 姜静; 刘桂丰; 许思佳; 李慧玉; 袁红梅

来源：植物研究, 2016, 36(06): 909-916.

• 白桦
• 纤维素
• 木质素
• 生物信息学
• 表达量

从白桦45个转录组数据中分析获得6条白桦纤维素合成酶基因,其中2条为该家族的新基因,通过生物信息学及实时定量PCR技术探讨白桦Bp Ces A在不同材性白桦中的表达量情况。结果表明,6条白桦Bp Ces A基因的ORF长度在2 9583 312 bp,编码的氨基酸数目在9851 103 aa,相对分子量在110.40124.29 k D,理论等电点为5.907.43;6条Bp Ces A均含有D,D,D,QXXRW保守结构域和8个跨膜螺旋,其中2个位于N端,6个位于C端。对来自6个双子叶植物,4个单子叶植物和1个裸子植物的52条Ces A进行了聚类分析发现:白桦Bp Ces A与同为木本的杨树Ptr Ces A具有较高的同源性,其中Bp Ces A2与Ptr Ces A3同源性达到92%、另外Bp Ces A5与Ptr Ces A6、Bp Ces A1与Ptr Ces A8也具有较高的同源性,分别为89%和82%。Bp Ces A1、Bp Ces A2、Bp Ces A3、Bp Ces A5基因随纤维素含量的增加,表达量也呈现增加趋势,推测这些基因在白桦的纤维素合成中起到促进的作用。本研究为揭示纤维素合成酶基因的功能分析提供了基础。

• 单位
  林木遗传育种国家重点实验室; 黑龙江省农业科学院经济作物研究所; 东北林业大学