龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果质量QTL定位

作者：张晨晨; 王佳卉; 刘丽琴; 王一承; 周建男; 胡小文; 石胜友^*

来源：中国南方果树, 2022, 51(02): 89-96.

DOI：10.13938/j.issn.1007-1431.20210167

• 龙眼
• 高密度遗传图谱
• 高通量测序
• QTL定位
• 连锁群

以“凤梨朵”ד大乌圆”的杂交后代F1 200株(FD群体)作为作图群体，结合父母本，利用RAD-seq技术开发SNP标记，采用Joinmap 4.1软件构建遗传图谱，使用Mergemap进行整合；并采用MapQTL软件对单果质量进行QTL定位，确定QTL位点的数量、位置。结果表明，使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合，整合图谱共形成15个连锁群，总的遗传距离为2 873.39 cM,平均遗传距离为0.36 cM,包含8 014个SNP位点。在该图谱上监测到65个与单果质量性状相关的QTL位点，分布于lg1、lg3、lg4、lg5、lg8、lg10、lg14连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多，密度最高的遗传图谱，为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。

• 单位
  农业部; 华中农业大学; 园艺林学学院; 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所