宏基因组二代测序在肺部感染性疾病病原学诊断中的价值

作者：朱晨; 杨坚; 王寿寿; 江占世; 朱启武; 刘书盈^*

来源：中国临床实用医学, 2023, 14(01).

• 肺部感染性疾病
• 宏基因组二代测序技术
• 支气管肺泡灌洗液

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染性疾病病原学诊断中的价值。方法本研究为横断面回顾性研究, 选取2019年6月至2021年6月滨州医学院烟台附属医院呼吸与危重症医学科收治的82例肺部感染性疾病患者, 男42例, 女40例, 年龄(53.12±22.38)岁, 年龄范围为31～75岁。检测支气管肺泡灌洗液(BALF)、血液、肺组织、胸水、痰液、咽拭子mNGS的结果, 与常规病原学检测方法结果比较, 分析mNGS在肺部感染性疾病病原学诊断中的价值。结果在BALF、血液、肺组织、胸水、咽拭子中, mNGS检测致病菌阳性率分别为88.4%(38/43)、69.6%(16/23)、100%(6/6)、75.0%(3/4), 100%(3/3);常规病原学检测致病菌阳性率分别为25.6%(11/43)、8.7%(2/23)、33.3%(2/6)、0%(0/4)、33.3%(1/3)。两者比较, 差异均有统计学意义(P<0.05)。mNGS灵敏度为81.8%, 特异度为55.6%, 常规病原学灵敏度29.1%, 特异度为92.6%。mNGS检测结果中排在前5位的为人类疱疹病毒、结核分枝杆菌、链球菌、烟曲霉、念珠菌。结论 mNGS同常规病原学检测方法相比, 检测周期更短, 阳性率更高, 尤其在诊断特殊病原体, 如结核分枝杆菌、真菌方面, 首选BALF作为检测标本。mNGS诊断肺部感染性疾病较常规病原学检测方法更快速、全面、准确, 可作为肺部感染性疾病病原学诊断的方法之一。

• 单位
  济宁医学院附属医院; 烟台毓璜顶医院; 滨州医学院