润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测

作者：刘天娇; 张晶晶; 马洁桦; 潘连军; 阮红杰^*

来源：南京医科大学学报(自然科学版), 2021, 41(11): 1585-1591.

• 阴道润滑障碍
• 长链非编码RNA
• 共表达网络

目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log2FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中m RNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log2FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1 582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及c GMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。

• 单位
  南京医科大学