DNA条形码技术在中缅树鼩隆安种群和昆明种群鉴定中的研究

作者：王谷洋; 曹骥; 杨春; 李瑗; 李科志; 陆玉秀; 何盼; 范倪; 唐艳萍

来源：现代生物医学进展, 2017, 17(15): 2821-2842.

DOI：10.13241/j.cnki.pmb.2017.15.006

• CO1基因
• DNA条形码
• 中缅树鼩
• 物种鉴定

目的:本研究利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因(CO1)的一段保守区域作为DNA条形码技术的研究序列,探讨DNA条形码技术对中缅树鼩隆安种群和昆明种群进行分类鉴定的可行性。方法:对22只广西隆安树鼩和21只昆明树鼩样本的CO1基因进行PCR扩增、测序,应用MEGA V5软件对序列进行比对及分析其遗传距离,采用NJ法构建系统发育树。结果:中缅树鼩种群中,隆安种群、昆明种群和海南亚种的种内遗传距离为0.00%-0.79%,种群间遗传距离为9.71%-13.59%,中缅树鼩与普通树鼩的种间遗传距离为20.43%-24.11%,存在条形码间隔。系统发育树显示:隆安种群、昆明种群及海南亚种分别聚为一小支,分支置信度高达100%。结论:本研究结果表明DNA条形码技术有助于树鼩种群和亚种的分类鉴定,经CO1基因的测序分析证实广西隆安树鼩和昆明树鼩分属不同的种群。

• 单位
  广西医科大学附属肿瘤医院