成年小鼠ECSIT 3′-UTR的鉴定及功能分析

作者：周小蓉; 陆霞; 李建涛; 阙玲琍; 李跃华^*

来源：南京医科大学学报(自然科学版), 2021, 41(07): 937-942.

• 3′非翻译区
• 3′RACE
• ECSIT
• microRNA
• siRNA

目的:鉴定成年小鼠Toll途径进化保守信号介导因子(evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathways,ECSIT)的3′非翻译区(3′-untranslated region,3′-UTR)序列,并在细胞中验证非编码RNA对ECSIT表达的影响。方法:采用RACE技术克隆得到小鼠ECSIT 3′-UTR序列,并与基因组数据库进行比对;预测ECSIT 3′-UTR可能结合的微小RNA(microRNA,miRNA),并针对ECSIT的全长序列设计小干扰RNA(siRNA);通过Western blot分别检测使用不同miRNA和siRNA干扰后,细胞中ECSIT的表达。结果:成功鉴定了346 bp的小鼠ECSIT 3′-UTR,与NCBI上序列一致率达到99%;在细胞中miR-7-5p和siRNA1、2可以干扰ECSIT的表达。结论:成功鉴定得到成年小鼠心脏ECSIT m RNA 3′-UTR序列,该非编码区可作为非编码RNA的调控区域,为进一步从分子水平探明ECSIT在小鼠生长发育及疾病中的作用提供科学依据。

• 单位
  南京医科大学