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摘要
萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率。为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种，本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率，筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种。同时，以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据，利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs。其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位。qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL。利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证，发现在低温萌发期间，qLTG11-1区间内的LOC＿Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式。LOC＿Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶，可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性。本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种，并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因，可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考。
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单位广东省水稻育种新技术重点实验室; 广东省农业科学院水稻研究所
