小麦子粒粒重的全基因组关联分析

作者：孙胜楠; 许峰^*

来源：安徽科技学院学报, 2020, 34(05): 11-17.

DOI：10.19608/j.cnki.1673-8772.2017.0842

• 小麦
• 百粒重
• 基因芯片
• 全基因组关联分析
• 候选基因

目的:为解析淮河流域麦区小麦子粒粒重形成的遗传基础,在基因组水平上挖掘与目标性状显著关联的SNP位点。方法:利用Affymetrix 55K基因芯片对1个包含154份遗传材料的自然群体进行SNP分型,结合三年的表型数据开展全基因组关联分析。结果:小麦百粒重的变异系数范围为0.28%～7.15%,广义遗传率为77.56%;检测出14个显著关联位点,表型变异解释率的范围为11.60%～22.50%;在距离标记上下游范围内确定14个距离最近的推定基因作为候选基因;4个稳定关联的显著位点分别提高0.18、0.07、0.16、0.07 g的百粒重,均达到统计学上的显著水平。结论:检测到14个与子粒粒重显著关联的SNP位点,14个距离探针最近的候选基因。

• 单位
  安徽科技学院