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摘要
为分析筛选苦荞薄果壳性状形成的相关基因，本研究以‘云荞1号’和‘小米荞’杂交F2代按成熟前期、成熟期两个时期分别对厚、薄果壳苦养进行随机取样，利用转录组测序技术（RNA-seq）检测基因差异表达，并采用实时荧光定量PCR技术（RT-qPCR）进行验证。转录组测序组装共获得Unigene 103 175个，其中64 757个Unigene在公共数据库得到注释。对差异基因进行GO和KEGG分析，在果壳成熟前期和成熟期之间分别有3 294和6 913条差异基因，筛选出木质素合成途径中的CAD、CCoA-OMT、CCR、F5H、HCT、LAC、PAL等10个差异基因、3个NAC转录因子和9个MYB转录因子，这22个基因在苦荞薄果壳发育期呈下调表达，且厚果壳中的表达量均大于薄果壳苦荞。经RT-qPCR验证，表明这些基因的表达模式与转录组测序结果趋于一致，且基因表达存在显著差异，推测这些差异基因在苦荞薄果壳性状形成过程中具有重要作用。本研究通过转录组测序分析，筛选出与苦荞薄果壳性状形成的相关基因，为研究和利用薄果壳性状提供了科学依据。
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单位云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所; 云南省农业生物技术重点实验室; 山西中医药大学; 农业部
