菜薹KASP-SNP指纹图谱构建及品种鉴定

作者:任海龙; 许东林*; 张晶*; 邹集文; 李光光; 周贤玉; 肖婉钰; 孙艺嘉
来源:园艺学报, 2023, 50(02): 307-318.
DOI:10.16420/j.issn.0513-353x.2021-1046

摘要

利用前人已开发的200个芸薹种KASP-SNP分子标记对89份菜薹品种进行基因分型,共有131个标记分型成功,转化率为65.50%,缺失率为0.06,次要等位基因频率(MAF)为0.21,观测杂合度为0.21,多态性信息含量(PIC)为0.27,并将这些标记用于系统进化树构建及群体结构分析。进一步基于次要等位基因频率大于0.25,多态性信息含量大于0.35,缺失率小于0.03,杂合率小于0.6等参数,筛选出18个核心KASP-SNP分子标记,并构建了89份菜薹品种的SNP指纹图谱,证明了KASP技术在菜薹品种鉴定中的可行性。

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