基于液相色谱质谱联用的蛋白质组非标记定量研究策略的建立及应用

作者：陈明; 应万涛; 方勤美; 孙薇; 贺福初; 钱小红

来源：生物化学与生物物理进展, 2008, (04): 401-409.

• 液相色谱质谱联用
• 非标记定量
• 生物标志物 LC-ESI-MS/MS
• label-free
• biomarker

定量蛋白质组研究是蛋白质组研究的热点和难点,而液相色谱质谱技术已经被广泛地应用于蛋白质的定性和定量研究.该研究建立和优化了一种基于液相色谱质谱联用技术的蛋白质组非标记定量方法,并对两种肽段质谱检测计数的归一化算法进行了比较,结果发现ASC法要优于RSC法.最后,将建立的方法应用于肝癌细胞模型HepG2和HepG2-HBx细胞系的差异蛋白质组表达研究.质谱鉴定结果用聚类分析软件Cluster3.0进行分析,最后鉴定出107个重叠蛋白,其中9个蛋白质表达上调(Ratio>1.75),6个蛋白质表达下调(Ratio<0.5),这些蛋白质均与肝癌发生和恶化密切相关.结果表明,该技术操作简单、方便,具有...

• 单位
  北京蛋白质组研究中心; 军事医学科学院; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所; 蛋白质组学国家重点实验室