大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析

作者：宋晴晴; 张慧敏; 张烨; 张一卉; 李景娟; 李化银; 贺立龙; 王凤德^*; 高建伟^*

来源：山东农业科学, 2020, 52(03): 1-7.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2020.03.001

• 大白菜
• GID1基因
• 生物信息学分析
• 表达模式分析

GID1蛋白是赤霉素信号转导过程中的重要受体,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用。本研究采用生物信息学分析方法对大白菜基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、染色体分布、系统进化以及表达模式等进行分析。结果表明,大白菜基因组中含有5个GID1家族成员,分别位于4、5、6、7、9号染色体上,各成员都只含有1个内含子。系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白明显处于两个不同分支,大白菜GID1家族成员与拟南芥GID1具有更近的亲缘关系。通过表达模式以及启动子顺式响应元件分析发现,大白菜GID1基因不仅参与生长发育调控还可能参与对不同环境因子的响应过程。

• 单位
  生命科学学院; 山东省农业科学院; 黄山学院; 山东师范大学