SH3TC2促进结直肠癌的发生与进展——基于生信分析

作者：陈德合; 夏天红; 岳婷; 李洪涛^*

来源：河南大学学报(医学版), 2023, 42(02): 114-127.

DOI：10.15991/j.cnki.41-1361/r.2023.02.004

• 结直肠癌
• SH3TC2
• 预后
• 生存

目的：基于TCGA和GTEx样本数据信息挖掘在结直肠癌中异常表达且与预后相关的基因，以期提高其诊疗效果和改善预后生存。方法：利用GEPIA 2.0可视化分析平台对公共数据库中癌及癌旁1 034个组织标本数据进行差异表达和预后生存相关mRNA筛选，使用FunRich软件通过韦恩图筛选共同差异基因并进行GO和KEGG富集分析，再通过GEPIA2.0和UALCAN数据库进行关键差异基因的表达和预后验证；接着通过TIMER2.0数据库探索关键基因的表达水平与免疫细胞浸润的相关性；最后通过STRING数据库在线进一步分析关键基因的蛋白相互作用网络。结果：共筛选到11 106个差异表达基因(结肠癌5 337个，直肠癌5 769个),与二者预后OS及DFS相关的500个基因取交集，筛选出BGLAP、COQ2、CRLF1、PREX2、SH3TC2、PTPRM、ZNF154、HOXA4等8个表达差异基因且与预后生存DFS相关。验证后发现BGLAP、COQ2、CRLF1、PREX2、PTPRM、ZNF154、HOXA4可能在癌症的不同阶段发挥促癌、抑癌的双重功能；仅SH3TC2在结直肠癌中高表达(P<0.01),而预后生存分析表明高表达患者预后DFS显著更短(P<0.01),与预后OS无统计学差异(P>0.05);其表达水平与肿瘤免疫浸润评估显示结肠癌与CD4+T细胞浸润相关性，最高仅0.124(P=0.013),直肠癌中与免疫细胞浸润相关性无统计学意义(P>0.05);STRING数据库分析提示SH3TC2与SBF2、LITAF、MTMR2、MTMR2、GDAP1等蛋白相互作用可能性较大。结论：SH3TC2在结直肠癌中高表达，且高表达患者预后DFS更短，有可能是结直肠癌新的潜在诊断和预后DFS判断的标志物；SH3TC2表达水平在结直肠癌中与免疫细胞浸润相关性较弱。

• 单位
  宁夏医科大学; 商丘市第五人民医院