埃博拉病毒基因组中微卫星序列的分布分析

作者：周思倩; 焦伟丽; 彭珠黎; 周靖宇; 何兴鑫; 李都悦; 李明福; 谭钟扬^*

来源：基因组学与应用生物学, 2019, 38(03): 1087-1095.

DOI：10.13417/j.gab.038.001087

• 生物信息学
• 埃博拉病毒
• 微卫星序列

微卫星或简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)在真核和原核生物以及病毒基因组中普遍存在,并被广泛用于遗传与进化研究。本研究从NCBI中下载埃博拉病毒属的四个不同种的埃博拉病毒全基因组序列,筛选36条作为实验材料,利用IMEx在线提取软件提取SSRs,用Python编程统计数据,从而分析SSRs在埃博拉病毒全基因组序列中的分布情况。分析得出,埃博拉病毒基因组序列中二型SSRs含量最为丰富,其次是一型SSRs,三型SSRs有少量,四型SSRs则更少,没有发现五型和六型SSRs。在更深入的分析中

• 单位
  湖南大学