癌症分子靶点及其配体综合查询系统的构建

作者:王东海; 菅富元; 张翔; 连晨; 王义哲; 赵祉硕; 李文帅; 杨佩兰; 耿轩; 韩智豪*
来源:山东化工, 2023, 52(15): 200-207.
DOI:10.19319/j.cnki.issn.1008-021x.2023.15.038

摘要

建立了一个癌症分子靶点及其配体综合查询系统,在此系统中对肿瘤靶点及其配体(包括小分子抑制剂、抗体类药物、特异性配体蛋白)进行介绍、汇总。系统以网页形式可以快速浏览历年来研究成果较多的癌症分子靶点,并给出这些靶点的蛋白信息,并实现了与Uniprot数据库和PDB数据库的链接,以便于详细了解靶点蛋白信息及蛋白结构。每个靶点还会展示其靶点亲和力高的配体信息,如亲和力值、特殊连接基团、结构图、单价、药物描述等。此外,用户还可以通过筛选想要研究的配体,进行结构下载,并导入对接软件,实现和对接软件的互联互通,大大提高了对癌症分子靶点及其配体的信息获取速度,更加方便了研究者的研究。并通过癌症分子靶点及其配体综合查询系统的开发、浏览和研究,发现了一个有潜力的肿瘤影像靶标——FGFR4,其在多种肿瘤组织中高表达,而在正常组织中表达量较低,非常适合肿瘤成像的研究。

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