肠运动存在昼夜节律，表现为白天活跃，夜间减弱或消失，这是一种内生性的、由时钟基因控制的生物节律。肠运动节律既可与中央节律保持高度一致，也可独立于中央节律而对外周环境刺激做出反馈。外科手术会破坏肠运动的昼夜节律，而围手术期合理使用褪黑素、五羟色胺（5-HT）受体激动剂和非甾体类解热镇痛药等药物则有助于促进此节律的恢复。外科医生了解肠运动节律的机制，有助于加深术后肠麻痹（POI）的认识，再基于时辰药理学，在合适的时机以适宜的剂量给药，或许能进一步缩短POI时间，促进肠运动功能尽早恢复。
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