基于转录组测序的广藿香MYC基因家族鉴定与分析

作者：王瑜桑; 夏快飞; 张明永; 黄焕超; 严寒静; 张宏意; 何梦玲

来源：分子植物育种, 2024, 1-10.

• 广藿香
• MYC基因家族
• 转录组
• 生物信息学

MYC家族(myelocytomatosis proteins， MYC)是茉莉酸信号转导通路中的重要转录因子。利用生物信息学方法，本研究在广藿香茉莉酸甲酯处理后的转录组测序数据中共鉴定到21个广藿香MYC转录因子，并对其理化性质、亚细胞定位、保守结构域、系统进化和表达模式等进行分析。这21个MYC基因家族成员分别命名为PatMYC1～PatMYC21，每个PatMYC蛋白均含有bHLH＿MYC＿N结构域和bHLH结构域。PatMYC基因家族成员氨基酸数为420～702 aa，分子量为47 906.95～76 173.09 Da，理论等电点在4.67～8.78之间，预测为不稳定亲水蛋白，以α-螺旋和无规卷曲为主要构件。系统发育树分析表明PatMYC可分为四组。这些PatMYC基因可能参与调控了广藿香茉莉酸信号转导途径。本研究为进一步挖掘广藿香MYC基因家族功能提供了科学依据。

• 单位
  国家中医药管理局; 广东药科大学; 中国科学院华南植物园