基于RNA-Seq数据分析端粒酶对牛乳腺上皮细胞重编程进程的影响

作者:姜欣颖; 马利兵; 杨慧; 曲静; 仉亚利; 贺小英*
来源:动物医学进展, 2021, 42(11): 28-35.
DOI:10.16437/j.cnki.1007-5038.2021.11.006

摘要

为探究供体细胞的端粒酶修饰对细胞重编程的可能分子机制,利用腺病毒载体Ad-Max构建端粒酶基因hTERT的重组腺病毒,通过不同病毒滴度(MOI)感染乳腺上皮细胞筛选阳性细胞模型,并对制备的细胞模型进行相关生物学检测;其次构建hTERT过表达转录组文库,进一步分析端粒酶修饰后的牛乳腺上皮细胞体外模型的差异表达基因与重编程之间的关系。结果表明,当MOI为80时,获得细胞模型转染效率最佳;用RNA-seq构建的端粒酶过表达mRNA文库,发现有740个下调基因,有250个上调基因;GO富集分析显示,差异基因主要与细胞、组织、器官及个体发育进程有关,进一步KEGG通路分析显示差异基因主要参与调控乳腺上皮细胞多种生物学功能及细胞发育,且能够激活PI3K-AKT及Wnt信号通路。因此,初步证实端粒酶修饰的供体细胞对细胞重编程趋于有利的调控作用。

全文