犬ZP3的结构与功能分析

作者：赵勤涛; 张建华

来源：黑龙江畜牧兽医, 2016, (15): 23-288.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2016.1355

• 犬
• ZP3
• 生物信息学
• 结构预测
• 生物学功能

为了进一步研究家犬(Canis lupus familiaris)ZP3的生物学功能及作用机制,研究采用生物信息学的方法,从NCBI数据库中搜集犬ZP3基因的编码区序列(CDS),通过MAGE软件将其转化为蛋白质序列,利用Ex PASy、BLAST和DNAStar等生物信息学在线软件及程序对蛋白质的一级、二级和三级结构进行预测,运用PAML软件对11个物种ZP3基因进化、受到选择的位点进行分析,用Predictprotein和Weblogo分析了ZP3的保守性,采用Python和Py MOL对蛋白质的三级结构进行编辑。结果表明:犬ZP3基因编码426个氨基酸,编码产物是一个有信号肽的亲水跨膜蛋白,第123位氨基酸是信号肽区域,跨膜结构域在第386408位氨基酸的α螺旋区;有4个位点检测到受到磷酸化的作用,这些磷酸化位点可能与信号转导有关;在ZP结构域上有9个蛋白质结合位点;在ZP3的325385区段存在1个高变异区,并且大部分的磷酸化和受选择的氨基酸位点都分布在这一区域。说明该区域经历了快速的进化,暗示ZP结构域和该高变异区可能参与了精-卵的相互作用。

• 单位
  公安部南昌警犬基地