摘要
黑色素皮质素受体1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因。为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以390头杜黑猪F2代个体和18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F2代群体进行毛色表型类型分组,利用液相芯片捕获测序技术鉴定MC1R基因中影响毛色的10个SNP位点的基因型。结果表明,杜黑猪F2代群体出现了毛色分离,其中,75.13%的个体为全黑色,13.08%的个体为棕红色,其余11.79%的个体呈现混杂色,包括黑红条纹、棕色偏黄、棕色偏白等。测定的5个多态SNP位点中,ED1等位基因3个SNP位点(rs45435031、rs45434630、rs45434629)的突变纯合型(GG、GG、TT)个体表现为黑红条纹,野生纯合型(AA、AA、CC)个体表现为棕红色,杂合基因型(GA、GA、TC)个体大部分(80.83%)表现为黑色,少部分(19.17%)为黑色红纹、棕色偏黄和棕色偏白。e等位基因2个SNP位点(rs45435032、rs321432333)的突变纯合基因型(AA、TT)个体全部为棕红色,野生纯合基因型(GG、CC)个体全部为黑色毛色,杂合基因型(GA、TC,AA、TC,GA、TT)大部分(80.99%)为黑色毛色,少部分个体(19.01%)毛色为黑红条纹、棕色偏黄和棕色偏白。HaploView单倍型分析表明5个SNP高度连锁,位于1个单倍型块内。本研究结果表明,杜黑猪毛色黑色对棕红色为不完全显性,利用MC1R基因的5个SNP标记进行毛色分子标记辅助选择可快速剔除隐性棕红色等位基因,使杜黑猪新品种的毛色迅速固定为全黑色,以加速新品种培育进程。
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