羊肚菌转录因子分类和生物信息学分析

作者:任瑞芳; 张绍鹏; 蒋鹏; 张瑞; 张祚; 郑涵予; 史梦华; 马晓龙*
来源:食药用菌, 2022, 30(02): 127-132.

摘要

首次根据Genbank中已知的7237条羊肚菌序列,对所有编码转录因子的序列进行了功能分类,并重点对羊肚菌中的锌指蛋白(ZFP)编码序列进行了生物信息学分析。结果表明,Genbank中所有7237条羊肚菌来源的核苷酸序列,有167条是编码转录因子的序列,其中88条序列编码了锌指蛋白。这些序列都含有相应的保守基序,编码蛋白质的二级结构以α-螺旋为主,三级结构极为相似,功能上以亲水性蛋白为主。