基于流式细胞仪高通量分选的深海微生物单细胞培养

作者：阮楚晋; 郑小伟; 王丽; 王铱; 朱雅新; 王剑; 贠娟莉; 董志扬; 陆祖军; 黄英; 杜文斌; 黄力; 戴欣

来源：微生物学报, 2021, 61(04): 816-827.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20200459

• 微生物培养
• 单细胞
• 流式细胞仪
• 深海

【目的】建立适用于海洋微生物的流式细胞分选与高通量单细胞培养的方法,通过该方法从印度洋深海样品中分离微生物纯培养菌株。【方法】利用流式细胞仪单细胞分选功能,以前向角(FSC)和侧向角(SSC)散射光信号代替荧光信号作为分选逻辑,对深海水体和沉积物样品中微生物进行单细胞高通量分选和培养。【结果】确定了流式细胞分选的区域和条件,发现所建立方法适于分离海洋水体微生物,而不是沉积物微生物。从印度洋深海水体样品中获得61个潜在新菌株,分属于6个新属种,占分离菌株总数的26.29%,其16S rRNA基因序列与已培养的模式菌株相似性为89.79%–95.37%。【结论】本研究所建立的方法有助于提高发现海洋微生物新物种的效率,获得更多新的海洋微生物资源。

• 单位
  广西师范大学; 生命科学学院; 微生物资源前期开发国家重点实验室; 中国科学院微生物研究所; 中国科学院大学