基于SLAF-seq技术的葡萄种质遗传多样性分析

作者：李贝贝; 张恒; 姜建福; 张颖; 樊秀彩; 房经贵^*; 刘崇怀^*

来源：园艺学报, 2019, 46(11): 2109-2118.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-1089

• 葡萄
• SLAF-seq
• SNP
• 遗传多样性

利用简化基因组测序技术(SLAF-seq)对304份葡萄种质进行测序,最终获得466 618个SLAF标签,其中多态性SLAF标签392 374个。通过序列分析,获得481 192个有效单核苷酸(SNP)多态标记,并基于这些SNP分析和构建了304个葡萄种质的群体结构和系统发生树。结果表明,SLAF-seq技术能高效、低廉地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记。通过构建进化树分析发现,欧亚种、欧美杂种及野生种葡萄彼此分开,其中姊妹系品种及具有亲子代关系的品种各自聚在一起,中国葡萄地方品种与国外古老葡萄品种的亲缘关系最近,且起源及遗传背景不详的古老葡萄品种与野生种的亲缘关系较改良品种更近。该结果可为后期进一步研究葡萄的起源进化提供参考,同时为构建SNP指纹数据库提供了基础数据。

• 单位
  南京农业大学; 中国农业科学院郑州果树研究所