为准确高效地鉴定番茄杂交种纯度，以美小红及其父母本为试验材料，从48对核心InDel标记中挑选3对在双亲中具有明显差异且条带清晰的InDel标记，对100个美小红单株进行纯度检测，并与田间调查结果相比较。结果表明，在3对分子标记检测结果中，100个杂交种单株中有98个表现为父母本双亲互补的共显性条带，2个单株表现为母本类型的条带，种子纯度为98%，上述结果与大田鉴定结果高度一致。因此，利用该方法可准确高效地检测杂交种纯度，节约检测成本，缩短检测时间。
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