内蒙古地区绵羊梅迪-维斯纳病毒全基因组序列的测定与分析

作者：赵玲; 王振玲; 史晓娜; 段续接; 张良; 李慧萍; 刘淑英^*

来源：中国预防兽医学报, 2021, 43(11): 1140-1145.

• 梅迪-维斯纳病毒
• 二代测序技术
• gag
• env
• 遗传变异

为了解内蒙古地区绵羊梅迪-维斯纳病毒(MVV)的分子结构特征和遗传变异情况,本研究利用Illumina Hiseq 4000二代测序技术对MVV阳性绵羊病肺组织进行病毒全基因组测定,并对全基因组特征、gag和env及其编码的氨基酸序列进行系统进化分析。结果显示,获得全长9 193 bp的MVV全基因组序列,命名为NM1111,并上传GenBank获得基因登录号MW248464;全基因组、gag和env核苷酸序列与参考株的相应核苷酸序列的同源性分别为75.8%～81.4%、77.1%～86.8%和67.7%～75.5%;基于gag序列的系统进化分析,NM1111与A2型MVV聚为一支,属于A2型;Gag蛋白的主要同源区(MHR)存在D296E的突变,Env蛋白变异程度较大,表面蛋白V4区存在氨基酸插入,SU5抗原表位在氨基端有一个完全保守的基序(VRAYTYGV),在羧基端有一个高度可变的基序。本研究提供了中国地区首个绵羊MVV完整序列,为中国地区MVV分子生物学特性研究提供基础参考。

• 单位
  内蒙古农业大学; 农业部; 北京农业职业学院