利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究

作者：雄英; 李明珍; 张攀攀; 张理意; 杨跃

来源：中国肺癌杂志, 2017, 20(11): 727-731.

• 肺肿瘤
• 高通量测序
• SPRR家族

背景与目的目前尚无有效的靶向药物用于肺鳞癌的临床治疗,在肺腺癌中有效的靶向药物却无法让鳞癌患者获益,而研究者对肺鳞癌的靶点知之甚少。本研究重点筛选并鉴定肺鳞癌的特异关键基因,为肺鳞癌的治疗提供新的靶点。方法转录组测序检测5例肺鳞癌患者的配对肺癌组织及正常肺组织样本,使用生物信息学分析筛选两组之间的差异编码基因,进而应用实时定量PCR验证关键差异基因在肺癌细胞系的表达情况。结果转录组测序结果显示,与正常肺组织相比,肺鳞癌组织上调的差异基因数目为534条。位于前十位肺癌组织高表达的基因包括GAGE12J、SPRR3、PRAME、SPRR1A、SPRR2E、MAGEA3、SPRR1B、IL36G、TMPRSS11D和SPRR2D。进而于不同生物特征的肺癌细胞系H520、GLC82、A549、H1299及PC9验证SPRR家族表达状态,我们发现在淋巴结转移细胞系H1299处于高表达水平。结论高通量转录组测序筛选到肺鳞癌异常高表达基因SPRR家族,此家族与肺癌淋巴结转移相关,为肺癌的靶向治疗提供了新的思路。

• 单位
  北京市理化分析测试中心; 北京肿瘤医院; 北京市肿瘤防治研究所; 恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室