基因芯片筛选MiR-133b在结直肠癌细胞系中的靶基因

作者:杜鹃; 李小荣; 胡桂; 林昌伟; 高凯
来源:世界最新医学信息文摘, 2017, 17(62): 6-7.
DOI:10.19613/j.cnki.1671-3141.2017.62.003

摘要

目的将miR-133b转染后与未转染的结直肠癌细胞配对进行基因芯片高通量测序及基因的功能注释,筛选出miR-133b在结直肠癌中相关的靶基因。方法将结直肠癌细胞系SW620及HT29分成4组进行转染,将miR-133b mimics转染组与NC转染组配对进行基因芯片测序,经多重筛选后的基因进行功能注释。结果 1.两种细胞系与对照组相比较,miR-133b mimics转染组miR-133b的表达显著上调(SW620:(502.46±16.84),P<0.01;HT29:(332.39±13.04),P<0.01)。2.最终筛选出9个相关靶基因,通过功能注释后发现其中有部分基因可能参与了结直肠癌的发生发展、侵袭转移等过程。结论 1.miR-133b mimics可成功转染于结直肠癌细胞系SW620及HT29,且在这两种细胞系中高表达。2.经过基因芯片及靶基因预测软件筛选出的miR-133b的9个靶基因,可能与结直肠癌机制相关。

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