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摘要
WRKY转录因子在生物过程的调控中发挥着重要作用，探讨参与鳄梨非生物胁迫响应相关的WRKY转录因子具有重要意义。利用本地BLAST比对获得鳄梨全基因组的WRKY转录因子基因序列，分析PaWRKY转录因子蛋白理化性质，保守基序预测，构建蛋白系统进化树，从而推断PaWRKY的基因功能，对PaWRKY进行分类，并通过转录组测序分析参与干旱和低温胁迫的WRKY基因。从鳄梨全基因组中分析得到71个PaWRKY基因序列，转录组表达分析显示有65个PaWRKY在干旱胁迫下表达，64个PaWRKY在低温胁迫下表达，将干旱和低温胁迫下表达量差异显著的19个鳄梨WRKY基因与其他11个功能已验证的WRKY转录因子共同进行系统进化树构建。结果显示，30个WRKY转录因子聚为两大类，响应干旱和低温胁迫的基因集中在Ⅱ类中。其中PaWRKY12与拟南芥的AtWRKY48聚为一支，PaWRKY39、PaWRKY64与拟南芥的AtWRKY57聚为一支，PaWRKY42与抗旱玉米的ZmWRKY40聚为一支，PaWRKY19与耐寒陆地棉的GhWRKY73聚为一支，PaWRKY51与小麦的TaWRKY10、TaWRKY19聚为一支，PaWRKY2与参与抗旱水稻的OsWRKY11聚为一支，PaWRKY6与耐寒的陆地棉GhWRKY62及耐冷、耐盐的小白菜BcWRKY46聚为一支。本研究为深入研究鳄梨WRKY转录因子非生物胁迫提供科学理论依据。
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