亚洲栽培稻程氏指数与SSR标记分类的比较分析

作者：王彩红; 徐群; 于萍; 袁筱萍; 余汉勇; 王一平; 汤圣祥; 魏兴华

来源：中国水稻科学, 2012, (02): 165-172.

• 亚洲栽培稻
• 分类
• 程氏指数
• 简单重复序列 Oryza sativa L.
• classification
• Cheng's index
• simple sequence repeat

选取具有代表性的100份亚洲栽培稻品种,应用程氏指数和109个SSR分子标记对它们进行分类。结果表明,等位酶Ⅰ群(典型籼稻)和Ⅵ-A群(温带粳稻)程氏指数和SSR标记亚结构特征均十分明显,拟合度较高(73.3%～100%)。Mantel检测揭示,程氏指数与SSR分子标记进行栽培稻分类存在明显的正相关,两种方法各个材料间遗传距离的相关达极显著水平(r=0.466,P<0.01)。遗传结构和聚类分析表明,在籼粳亚种水平上,程氏指数和SSR标记分类结果趋于一致,但在亚种内亚结构分析中,程氏指数偏差较大,SSR标记具有更高的准确性。同时,SSR分析表明混合型材料多存在于Ⅱ群和Ⅵ群内部。

• 单位
  中国水稻研究所; 水稻生物学国家重点实验室