基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗结肠癌的潜在机制

作者:王珍; 黄俊; 韦镔倩; 赵培庄; 宁佳佳; 黄雪*
来源:基因组学与应用生物学, 2023, 42(11): 1223-1234.
DOI:10.13417/j.gab.042.001223

摘要

本研究依托网络药理学,从多靶点、多途径的角度分析白藜芦醇(resveratrol, RES)治疗结肠癌的潜在机制。从Swiss Target Prediction、 TCMSP、 UniProt、 OMIM、 GeneCards和PubChem数据库中获取白藜芦醇治疗结肠癌的目标基因,使用Venn 2.1.0确定交集基因。通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络。使用Cytoscape软件对PPI网络相互作用进行拓扑分析。使用R程序包进行GO和KEGG富集分析,并筛选出相关信号通路。使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。随后通过RT-qPCR、 Western blot和划痕实验进行体外验证。筛选得到白藜芦醇治疗结肠癌的潜在靶点152个,通过CytoHubba分析得到10个关键基因。GO富集分析显示,细胞膜是生物过程发生的主要场所。KEGG结果表明,PI3K/AKT是白藜芦醇治疗结肠癌的关键信号通路。分子对接结果显示白藜芦醇与关键靶蛋白之间结合力良好。RT-qPCR结果显示,白藜芦醇对关键基因起到了相应的调节作用。Western blot结果显示,白藜芦醇可以下调HT-29结肠癌细胞模型PI3K/AKT通路的表达。划痕实验显示,HT-29细胞的迁移受到白藜芦醇的抑制。本研究表明白藜芦醇可以通过多个靶点和途径发挥抗结肠癌作用,也显示了网络药理学在药物研究中的潜力。

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