政府审计和注册会计师审计是审计行业不可或缺的两个组成部分。现通过对比两者的优劣势和两者在资源整合中存在的问题,提出加强审计经费投入力度;建立审计组织平台和资源整合流程;建立内在激励机制;加强绩效考核等解决措施,以期促进审计资源的协同利用。