甘肃特产药材红芪actin基因片段的克隆及序列分析

作者:何军刚; 强正泽; 马冬妮; 冯晓莉; 李成义*
来源:中国现代中药, 2020, 22(12): 1972-1976.
DOI:10.13313/j.issn.1673-4890.20200226002

摘要

目的:研究红芪Hedysari Radix次生代谢产物与基因表达的相关性,克隆红芪的肌动蛋白基因(actin)并进行序列分析和定量研究。方法:通过查找GenBank中的其他豆科植物的编码序列(CDS)设计简并引物,采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术克隆红芪actin基因的核心片段,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析该基因在不同部位中的稳定性表达。结果:克隆出了长度946 bp的红芪actin基因,其中编码蛋白框855 bp,编码284个氨基酸,经Blast比对序列,红芪的actin基因与甘草Glycyrrhiza uralensis Fisch.、花苜蓿Medicago ruthenica(L.) Trautv.、红车轴草Trifolium pratense L.的核苷酸序列同源性分别为95.44%、94.42%、94.20%,氨基酸序列的相似性也高达97%以上,红芪actin基因在根、茎、叶不同部位中的表达量基本稳定。结论:首次在国内成功克隆出了红芪的actin基因,并且证实了该基因可作为红芪其他优良基因表达调控的内参基因,为红芪质量研究提供参考。

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