马疱疹病毒5型的鉴定及遗传进化分析

作者：佟盼盼; 张磊; 宋小珍; 任美灵; 贾陈阳; 帕丽旦·努尔兰; 谭美玲; 况玲; 谢金鑫^*

来源：动物医学进展, 2021, 42(04): 35-38.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2021.04.008

• 马疱疹病毒5型
• 纯血马
• gH基因
• 进化树

采集乌鲁木齐某马术俱乐部226匹纯血马鼻拭子样品,用高通量测序检测纯血马携带病毒多样性,结果宏病毒组学分析共产生73 664 946条reads,有16 067条reads(0.022%)注释为哺乳动物病毒,其中105条reads注释到马疱疹病毒5型(EHV-5)gH基因。根据GenBank中的EHV-5参考株2-141/67 gH基因序列,设计特异性引物,验证宏病毒组学结果,并对gH基因的氨基酸序列进行遗传进化分析。结果14匹健康纯血马鼻拭子样品呈EHV-5阳性,阳性率为6.2%(14/226),序列分析表明,鉴定的14株EHV-5 gH基因的核苷酸和氨基酸序列与澳大利亚、意大利及日本分离株gH基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.4%～100%和90.3%～100%。遗传进化分析显示我国14株EHV-5与澳大利亚2-141/67和EHV-5.2-141株亲缘关系较近,而与意大利glycoprotein H株、日本16-I-1064和1-I-790株处于不同分支。

• 单位
  新疆农业大学