厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs分析

作者：李树斌; 于鸿^*; 张耿月

来源：中华肺部疾病杂志(电子版), 2020, 13(03): 365-370.

• 非小细胞肺癌
• 厄洛替尼耐药
• 差异表达
• IncRNAs分析

目的筛选并分析厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs。方法在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中挑选数据集GSE80344,其数据来自厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞。通过GEO2R和探针匹配分析差异表达mRNAs和lncRNAs,筛选标准为|Fold change|> 1. 5,P value <0. 01。通过Panther (http://www. pantherdb. org)、KEGG (http://www. kegg. jp/)、STRING(http://string-db.org)等数据库分析筛选得到的差异表达mRNAs和lncRNAs的可能的作用机制。通过TCGA(https://cancergenome.nih.gov/)数据库对筛选得到的关键mRNAs和lncRNAs进行生存分析验证。结果厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞相比,差异表达mRNAs共644个,差异表达lncRNAs共367个,其中128 mRNAs表达上调,516 mRNAs表达下调; 137 lncRNAs表达上调,230lncRNAs表达下调。这些mRNAs和lncRNAs主要涉及在PI3K-Akt、Ras、MAPK、ECM受体相互作用等与癌症密切相关的信号通路中发挥作用。基于数据库的分析验证结果与筛选结果一致。结论筛选分析得到的关健mRNAs和lncRNAs可为深入研究非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药机制的前期实验依据。

• 单位
  中国中医科学院广安门医院; 吉林省肿瘤医院