新型冠状病毒ORF3a蛋白质的生物信息学分析

作者：王瑄; 李祥芳; 丁寿鹏; 吴利先^*

来源：中国感染控制杂志, 2023, 22(02): 224-228.

• SARS-CoV-2
• ORF3a
• 生物信息学分析
• 多表位疫苗

目的 用生物信息学分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因ORF3a蛋白质。方法 从UniProt数据库获取ORF3a蛋白质的氨基酸序列，应用ProtParam tool分析其理化性质，SOPMA、SWISS-MODEL预测二、三级结构，PortScale、Signal IP 4.0 Server、TMHMM Server 2.0分析ORF3a蛋白质亲疏水性、信号肽、跨膜区。应用ABCpred、SYFPEITHI和NetPhos 3.1 Server预测B、T细胞表面抗原表位及磷酸化位点，VaxiJenv 2.0、AlgPred server预测抗原性和过敏原性。结果 ORF3a蛋白质含275个氨基酸，为稳定、疏水性蛋白质，有3个跨膜螺旋区、29个磷酸化位点，含多个T、B细胞抗原表位，具有抗原性和非过敏原性。结论 ORF3a蛋白质结构稳定，含多个T、B细胞抗原表位，可为研究SARS-CoV-2多表位疫苗提供基础。

• 单位
  大理大学; 基础医学院; 南昌大学