牛源CCR7基因克隆、生物信息学及表达分析

作者：申祥; 陈伶慧; 姚竞杰; 王三虎; 白跃宇; 张晓建^*

来源：中国畜牧兽医, 2022, 49(04): 1244-1252.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.04.005

• 奶牛
• CCR7基因
• 克隆
• 生物信息学分析
• 表达

【目的】探究CC趋化因子受体7(CC chemokine receptor 7,CCR7)基因编码蛋白的生物学特性及其mRNA在健康和炎性奶牛乳腺组织中的表达量。【方法】使用PCR扩增并克隆中国荷斯坦奶牛CCR7基因CDS区，测序后进行相似性比对及系统进化树构建；使用多种生物信息学软件分析CCR7蛋白的组成、理化性质及结构等；使用实时荧光定量PCR技术检测CCR7基因在健康和炎性奶牛乳腺组织中的表达差异。【结果】中国荷斯坦奶牛CCR7基因CDS区全长1 325 bp,与绵羊的相似性较高(95.2%),亲缘关系较近；与鸡的相似性较低(56.4%),亲缘关系较远。CCR7基因编码379个氨基酸，其中亮氨酸含量最多，缬氨酸含量次之，组氨酸和色氨酸含量最低；CCR7蛋白分子质量为14.56 ku,理论等电点为8.89,平均亲水系数为0.640,是一种跨膜疏水性蛋白。CCR7蛋白信号肽切割位点可能存在于第24和25位氨基酸之间。CCR7蛋白二级结构中α-螺旋占比最大，高达51.72%,三级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲。CCR7基因在炎性奶牛乳腺组织中的表达量极显著高于健康乳腺组织(P<0.01),其可能在奶牛乳腺炎的免疫调控中有着重要的作用。【结论】试验成功克隆出牛CCR7基因CDS区序列，并进行了相应的生物信息学分析及组织定量表达，为进一步研究CCR7基因的具体功能提供材料，对于探究CCR7基因在奶牛乳腺炎中的调控功能具有重要的意义。

• 单位
  河南科技学院; 动物科技学院