红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析

作者：李翔; 范作义; 王井源; 王淇; 李喜鹏; 王德秋; 孔令远; 曹森林; 孟庆刚; 赵曦阳^*

来源：植物研究, 2020, 40(03): 447-457.

• 红松
• 查尔酮合成酶
• 密码子偏好性
• 聚类分析

查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)广泛存在于植物体内,是花色素形成过程中一种重要的酶,可以进一步催化生成黄酮类化合物。本研究采用Codon W和EMBOSS在线软件对红松查尔酮合成酶基因CHS的密码子使用偏好性进行分析,并与北美乔松等其他24种植物的CHS基因以及模式植物基因组进行比较,对认识红松CHS基因的密码子使用偏好性,为选择适宜的表达系统奠定了一定的基础。研究结果表明:红松CHS基因编码区的有效密码子数(ENC)和GC含量分别为48.92和0.548,C+G含量高于A+T含量,密码子偏好以A/T结尾;多数植物CHS基因的G+C含量高于A+T含量,且密码子更偏好C/G结尾;聚类分析表明,红松与马尾松和赤松的密码子使用偏好性的相似性较高;密码子使用频率研究发现,红松CHS遗传转化与异源表达较优的受体可能是大肠杆菌和拟南芥。

• 单位
  林木遗传育种国家重点实验室; 东北林业大学