低氧胁迫下斑马鱼鳃microRNAs差异分析

作者：林枫; 贾若南; 王法祥; 许强华^*

来源：南方水产科学, 2022, 18(03): 86-93.

• 斑马鱼
• miRNAs
• 高通量测序
• 热休克蛋白基因
• 靶基因预测

为研究microRNAs (miRNAs)应对低氧胁迫的生物学功能，对低氧胁迫和常氧条件下斑马鱼(Danio rerio)鳃组织进行高通量miRNAs测序，分析了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中miRNAs的表达差异。结果表明，低氧胁迫和常氧条件下，斑马鱼鳃中共有15个miRNAs呈显著差异表达，其中13个miRNAs在低氧胁迫斑马鱼鳃中的表达量显著上调，2个miRNAs表达量显著下调。对miRNAs测序和斑马鱼鳃转录组进行关联分析，针对前期筛选获得的低氧胁迫与常氧条件下显著差异表达的28个热休克蛋白基因进行靶基因预测，结果显示，低氧胁迫下显著低表达的miR-455-3p同时靶向提高热休克蛋白基因hspa14和dnajb6b的表达，以增强对低氧的适应能力。另外，低氧胁迫下显著高表达的miR-194a和miR-155可以分别靶向5个热休克蛋白基因(hspa12a, dnajc5aa, hspb7, hsp70.3, dnajb2)和4个热休克蛋白基因(hspa12a,hspg2, hspa13, dnajb2)来调控斑马鱼对低氧环境的适应。

• 单位
  上海海洋大学