SARS病毒和其他冠状病毒中性突变速率初步的比较研究

作者：孙慧敏; 唐晓凤; 王波; 谭雅慧; 于晓寒; 张景霞; 闫永平; 夏结来; 徐德忠

来源：中华疾病控制杂志, 2011, (12): 1026-1030.

• SARS病毒
• 冠状病毒科
• 中性突变速率 SARS virus
• Coronaviridae
• Neutral mutation rate

目的比较SARS冠状病毒(SARS-CoV)与第1至第3组(其他3组)冠状病毒的中性突变速率之异同,为更深入研究SARS-CoV起源提供新的思路。方法在美国国立生物技术信息中心中获取其他3组26条病毒序列,同时选取7条SARS-CoV序列。计算各病毒株5个主要基因串联序列的同义替换核苷酸的数量(Ks值),以此值与时间创建散点图,并进行直线拟合,取得各自中性突变速率并比较。结果 SARS-CoV中性突变速率为7.33×10-6/位点.天,而其他3组冠状病毒为2×10-6/位点.天,仅约前者的1/3.5,但决定系数R2极低,无意义。经多种拟合检验,发现标本量和离散性不是本文R2低值的主要原因。结论...

• 单位
  第四军医大学