应用基因芯片筛选不同胶质瘤细胞相关基因

作者：张红; 楚胜华; 冯东福; 马延斌; 邱建华; 朱志安

来源：中华实验外科杂志, 2012, 29(2): 253-255.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2012.02.030

• 胶质瘤
• 基因芯片
• 基因表达

目的 应用高密度寡核苷酸(Oligo)基因芯片技术筛选不同胶质瘤细胞相关基因.方法 提取星形胶质细胞瘤CHG-5细胞株(WHO分级Ⅱ级)、星形胶质细胞瘤U373细胞株(WHO分级Ⅲ级)、星形胶质细胞瘤SHG-44细胞株(WHO分级Ⅳ级)和神经胶质细胞U257细胞株的总RNA并逆转录为cDNA,其中cy5、cy3的dNTP分别掺入不同胶质瘤细胞和神经胶质细胞的cDNA,混合后杂交含22000个人类基因人类高密度Oligo基因芯片,经过洗片和扫描,获得荧光信号图像并用计算机分析,抽取4种差异表达基因用聚合酶链反应(PCR)验证它们不同胶质瘤细胞和神经胶质细胞中的差异表达.结果 从22000条基因中筛选出差异表达基因242条,其中123条表达上调,119条表达下调,包括细胞凋亡、细胞周期蛋白、细胞骨架和运动蛋白等相关基因.结论 基因芯片技术的胶质瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胶质瘤相关基因,并高效对基因功能进行研究,有助于认识肿瘤发病机制.

• 单位
  上海交通大学医学院附属第三人民医院