装饰短蚋线粒体全基因组序列测定与分析

作者：孙谦; 杨明^*; 温小军^*

来源：贵州医科大学学报, 2023, 48(08): 881-887.

DOI：10.19367/j.cnki.2096-8388.2023.08.002

• 装饰短蚋
• 线粒体基因组
• 密码子
• 蛋白质编码基因
• 系统发育关系
• DNA条码
• 控制区

目的 测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列，并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系。方法 采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测序，应用邻接法重建装饰短蚋与其近缘物种的系统发育关系。结果 装饰短蚋线粒体基因组序列全长为15 640 bp,包括13个蛋白质编码基因(PCGs)、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个控制区(CR),A、T、C、G碱基含量分别为38.1%、36.4%、14.7%、10.8%;基于13个PCGs序列构建的系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.maculatum]+S.aureohirtum}+S.quinquestriatum,基于DNA条码序列构建系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.quinquestriatum]+S.maculatum}+S.aureohirtum。结论 短蚋亚属与蚋亚属杂色蚋组(variegatum group)的亲缘关系最近，利用线粒体全基因组进行系统发育分析DNA条码序列具有更高的分辨率。

• 单位
  基础医学院; 贵州医科大学