基于癌症基因图谱数据库分析SNRPEP2在肝细胞癌中的表达及其临床意义

作者：别蓓蓓; 周亚明; 严成俊; 孙晋^*

来源：浙江医学, 2022, 44(10): 1031-1037.

• 小核糖核蛋白多肽E假基因2
• 肝细胞癌
• 生物信息学
• 预后
• 诊断

目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据库探讨小核糖核蛋白多肽E假基因2(SNRPEP2)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义。方法 从TCGA数据库下载374例HCC组织样本和50例癌旁组织样本的转录组测序数据和临床资料，采用生物信息学方法，分析SNRPEP2在HCC中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系，运用Cox回归分析影响患者预后的危险因素并构建Nomogram预测模型，通过绘制ROC曲线评估SNRPEP2在HCC诊断中的效能。结果 HCC组织中SNRPEP2表达水平明显高于癌旁正常组织(P<0.01)。HCC中SNRPEP2高表达与肿瘤的组织学分级(OR=2.539,P<0.01)、血清甲胎蛋白水平(OR=2.966,P<0.01)、血管浸润(OR=1.658,P<0.05)和邻近肝组织炎症(OR=1.703,P<0.05)均有关，且SNRPEP2高表达患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)均低于低表达患者(均P<0.05)。多因素Cox回归分析显示SNRPEP2表达水平是影响HCC患者OS的独立危险因素(HR=1.970,P<0.01)。ROC曲线分析显示SNRPEP2表达水平对于诊断HCC、T1期、M0期、病理分期Ⅰ期，评估OS、DSS及PFI均具有良好的效能(均AUC>0.50)。结论 SNRPEP2高表达是HCC预后不良的独立危险因素且具有良好的诊断效能，有成为HCC诊断和预后判断标志物的潜在应用价值。

• 单位
  西安交通大学第二附属医院; 西安培华学院