本发明公开了一种酸性低共熔溶剂及制备与在预处理秸秆提高酶解效率中的应用。以含苯环的季铵盐和有机酸反应制备酸性低共熔溶剂,所得酸性低共熔溶剂在预处理秸秆提高酶解效率中的应用方法为:先将秸秆与DES溶剂混合进行预处理,然后进行木质素的提取和秸秆残渣的酶解糖化。本发明中秸秆木质素去除率达到75~84%,纤维素的保留率达到了90%,秸秆残渣酶解效率达到71~89%。本发明可在较低温度和较短时间内高效分离秸秆组分,提高木质素去除率的同时高度保留了纤维素组分,提高了酶解糖化效率。