基于GEO数据库的可卡因使用障碍潜在关键基因筛选及生物信息学验证

作者:朱有为; 王文政; 苏杭; 钟娜; 江海峰; 杜江; 赵敏*
来源:中国药物依赖性杂志, 2022, 31(05): 395-400.
DOI:10.13936/j.cnki.cjdd1992.2022.05.016

摘要

目的 应用生物信息学方法筛选可卡因使用障碍的核心基因和信号通路。方法 从基因表达综合数据库下载基因表达数据集GSE54839。应用R软件筛选差异表达基因。使用DAVID数据库进行基因富集分析。使用STRING数据库构建蛋白互作网络,使用cytoscape筛选核心基因。结果 共筛选出51个差异表达基因,主要参与MAPK信号通路调控。4个核心基因ATF3,FOS,FOSB,JUN均属于转录因子基因。结论 MAPK信号通路和转录因子可能在可卡因使用障碍中起到重要作用。

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