糖尿病肾病患者两种不同组织差异基因的相关分析

作者：张金铭; 张莲; 倪利华; 冯惠玲; 吴小燕^*

来源：临床肾脏病杂志, 2022, 22(08): 630-637.

• 糖尿病肾病
• 生物信息分析
• 外周血单个核细胞
• 肾小球

目的 利用生物信息技术筛选糖尿病肾病（diabetic nephropathy,DN）患者外周血单个核细胞（peripheral blood mononuclear cells,PBMCs）与肾小球组织的差异基因，筛选诊断DN的生物标志物和治疗的靶向基因。方法 从基因表达综合（gene expression omnibus,GEO）数据库GSE142153中提取DN患者和健康人PBMCs基因表达数据，从GSE30528芯片中提取DN患者和健康人肾小球基因表达数据，采用GEO在线分析软件GEO2R和Excel筛选差异表达基因。结果 DN患者的PBMCs中有201个差异表达基因，肾小球组织中有845个差异表达基因。PBMCs的差异基因主要参与DN肾脏炎症反应。肾小球组织的差异基因主要参与肾系统发育。两个组织中有以下基因同时差异表达，分别是EMP1、MAFB、GADD45A、ATF3、RASL11B、F3、CCR2、TLR7、EGF、TIPARP、P2RY14、CD24、IGKC、DACH1。其中TLR7、CCR2、CD24、EGF、ATF3、MAFB、GADD45A、F3基因存在相互作用。结论 DN患者PBMCs和肾小球的差异基因不同，差异基因在DN中的作用机制也明显不同。有16个基因在DN的两个组织中同时差异表达，可以作为诊断DN的生物标志物。利用共有差异基因在PBMCs和肾小球中的表达规律，也许可以对DN进行无创检测。有8个共有差异基因在PBMCs和肾小球中互相作用，可以作为DN治疗靶点。

• 单位
  武汉大学中南医院