目的:运用君臣佐使理论指导医疗机构药事应急管理实践,为提高医院药学部门药事管理能力提供参考。方法:文章结合江苏省中医院药学部门应对新冠疫情的具体实际和既往药事管理经验,在君臣佐使理论指导下,对医疗机构药学组织、运行、管理等方面进行思考与总结。结果与结论:通过应急组织建设,建立稳定而和谐的药学团队,君臣佐使,相互协同,发挥综合作用,并采用多维度管理,实现各种背景下的药事工作科学管理。