烟草开花期全基因组关联分析

作者：孙滢; 姜自鹏; 刘洪泰; 孙明铭; 蒋彩虹; 任民; 刘旦; 罗朝鹏; 张剑锋; 杨军; 杨爱国; 程立锐^*

来源：中国烟草科学, 2020, 41(06): 1-6.

DOI：10.13496/j.issn.1007-5119.2020.00.089

• 单核苷酸多态性(SNP)
• 全基因组关联分析(GWAS)
• 烟草
• 开花期

烟草开花期影响烟叶的产量和品质,是决定生态适应性和产量的重要性状,与各种生物或非生物胁迫密切相关。研究烟草开花期的遗传规律,进而解析调控开花时间的分子基础,对烟草品种改良具有重要意义。本研究选用烟草MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-crossing)群体为材料,利用高密度烟草SNP(Single Nucleotide Polymorphism)芯片进行基因型分析,进而对开花期性状进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)。结果表明,共检测到13个与烟草开花期性状显著关联位点,其中位于12号染色体109 616 410bp位置上的SNP为最显著关联位点。根据参考基因组,初步确定了控制开花期的关键候选基因Ntab0279610,该基因与拟南芥控制开花的关键基因SOC1高度同源,可能在控制烟草开花时间上起到关键作用。研究结果为进一步揭示烟草开花期遗传调控机制及育种改良奠定了基础。

• 单位
  中国农业科学院烟草研究所; 中国烟草总公司郑州烟草研究院