结核分枝杆菌ClpC2基因序列分析及功能预测

作者：李岱容; 穆柳青; 张春燕; 杨春

来源：遵义医学院学报, 2014, 37(01): 57-61.

DOI：10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2014.01.002

• 结核分枝杆菌
• ClpC2
• 序列分析
• 功能预测

目的对结核分枝杆菌的基因clpC2(Rv2667)的同源基因进行序列分析和相似性比较,并对其编码蛋白进行理化性质及功能的预测,为ClpC2蛋白的结构与功能研究提供基础技术资料。方法根据GeneBank中分枝杆菌clpC2同源基因的核苷酸序列,进行多重序列比对和进化树构建;应用ExPA Sy在线序列分析工具,对结核分枝杆菌ClpC2蛋白质理化性质及保守结构域进行预测;应用Gene ontology(GO)在线软件对ClpC2蛋白酶的功能进行分析。结果 clpC2系统进化树分析,与16 s rRNA基因相比,进化距离明显变大,而在结核分枝杆菌复合群中高度保守。ClpC2蛋白为亲水性非跨膜蛋白,在细胞质表达,具有水解和催化功能,是一个依赖于ATP的Clp亚单位。结论 clpC2基因在结核分枝杆菌复合群中高度保守,其编码的蛋白ClpC2是一个依赖于ATP的水解蛋白酶。

• 单位
  重庆医科大学; 重庆医科大学附属第一医院