鸡SLMO2基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析

作者：朱慧媛; 张朋威; 徐硕辉; 李瑞婷; 高超群; 李文婷; 蒋瑞瑞; 孙桂荣; 韩瑞丽; 康相涛; 李东华

来源：中国畜牧杂志, 2022, 1-11.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220816-04

• 鸡
• SLMO2基因
• CDS区克隆
• 组织表达
• 生物信息学分析

为了探究类果蝇慢移基因的氨基酸序列特征，探索其在不同肤色鸡不同组织中mRNA表达变化规律，实验采集不同肤色鸡各组织，PCR克隆获得SLMO2完整CDS区，进行生物信息学分析及组织表达分析。实验得到SLMO2的CDS区序列全长560 bp，其中可编码氨基酸174个。生物信息学研究结果表明，鸡SLMO2蛋白并不具有信号肽和跨膜结构，蛋白主要结构以无规性卷曲的α-螺旋结构结合为主，且蛋白分布在线粒体内膜间隙。通过氨基酸序列对比发现，鸡与爪蟾的亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明，SLMO2在背肤组织中相对表达量极显著高于其他组织，且该基因在丝羽乌骨鸡背肤组织中表达量极显著高于“豫粉1号”H系鸡背肤组织中表达量。以上结果为进一步探究鸡SLMO2对黑色素沉积的调控机制提供了理论依据。

• 单位
  河南农业大学; 动物科技学院