木薯果胶甲基酯酶抑制因子MePMEI1的生物信息学分析

作者：周杨骄; 李瑞梅; 袁帅; 仇婷婷; 姚远; 刘姣; 符少萍; 段瑞军; 胡新文^*; 郭建春^*

来源：基因组学与应用生物学, 2019, 38(03): 1186-1192.

DOI：10.13417/j.gab.038.001186

• 木薯
• 果胶甲基酯酶抑制因子
• MePMEI1
• 生物信息学

为探讨木薯MePMEI1的分子结构特征。通过PCR扩增和测序技术及生物信息学分析工具对木薯MePMEI1基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明木薯MePMEI1基因编码区全长609 bp,编码202个氨基酸残基;MePMEI1基因编码蛋白分子量21.78 k D,理论等电点(pI)约为5.51;生物信息学预测发现,木薯MePMEI1蛋白是稳定的亲水蛋白;具有跨膜区为分泌蛋白;含有1个PMEI结构域,1个糖基化位点,31个磷酸化位点;二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白的生物功能可能与细胞被膜、酶和生长因子等相关。木薯MePMEI1基因的生物信息学分析为进一步研究其遗传特性和生理生化机制提供了理论依据。

• 单位
  中国热带农业科学院热带生物技术研究所; 海南大学; 农业部